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Durante la fase di conservazione degli alimenti possono avvenire contaminazioni pericolose per la salute dei consumatori, la principale causa di questi inconvenienti è la cessione di inquinanti da parte di contenitori non idonei alla conservazione di alimenti.
I prodotti maggiormente soggetti ad una contaminazione in fase di conservazione sono principalmente mandorle, mais, cereali e noci, alimenti che, se non vengono ben essiccati e/o trattati, possono subire alterazioni che causano effetti negativi al consumatore.
L’inquinamento più preoccupante è quello da micotossine, la quale ingestione non da effetti acuti, ma cronici.